Publicar una Colección en GBIF

Por favor toma en cuenta que estas paginas todavía están bajo de desarrollo, es decir en el proceso de traducción…
Si usted maneja bien los dos idiomas, inglés y español, ¿tal vez quiere contribuir al trabajo?
(por favor puede contactarse a CHLAL.help@gmail.com)

Un poco de contexto …

La Global Biodiversity Information Facility (GBIF) es una red internacional de investigación de biodiversidad global, financiado por los gobiernos del mundo. El objetivo de esta red es proveer acceso libre y gratuito a los datos de biodiversidad de cualquier organismo a todo el mundo.

GBIF mantiene una enorme base de datos de ocurrencias de especies. Su base de datos esta disponible públicamente, más específicamente, a científicos dedicados al estudio de la biodiversidad del planeta.

Es muy fácil publicar datos de ocurrencias a GBIF directamente desde de cualquier portal de Symbiota (como el Consorcio de Herbarios de Líquenes de América Latina, CHLAL) – si estos datos están manejadas directamente «en vivo» desde el portal, es decir la información está disponible 100% en linea. Para colecciones no manejadas en linea, donde la gente prefiere manejar sus datos por un sistema local y propietario (como Specify, Ke-Emu, etc.) sigue siendo posible utilizar el portal para subir datos a GIBIF, pero solamente cuando

  1. …estas colecciones no utilizan otra herramienta para publicar sus proprios datos (ejm., por un instante de IPT, VertNet, etc.), y cuando…
  2. … los datos de ocurrencia que se han subido a un portal de Symbiota (como CHLAL) incluyen su propio occurrenceID GUID (= identificador único global de ocurrencia). [Algunas bases de datos como Specify automáticamente incluye este identificador único global de ocurrencia (GUID) cuando suben los datos a un portal de Symbiota (como CHLAL ).]

Instrucciones Detalladas

Descarga aquí las instrucciones (en Inglés)

Como administrador de su colección es necesario antes que nada establecer una cuenta institucional en GBIF para tener un acuerdo institucional con GBIF que les permita publicar sus datos en la base de datos de GBIF. Es posible configurar esta cuenta institucional para la publicaciones de todas colecciones diferentes de su institución [como ejemplo revise la cuenta institucional de la Universidad Estatal de Arizona (= Arizona State University)].

Importante: Si usted es administrador solamente una colección especifica dentro de su institución es necesario coordinar con sus colegas como establecer esta cuenta institucional de GBIF!

Entienda que cada registro de datos de cualquier colección que sea parte de su institución puede publicar sus datos en GBIF independientemente, utilizando herramientas diferentes. Por ejemplo, posiblemente usted prefiera publicar sus datos zoológicos por VertNet, sus datos de plantas vasculares en SEINet y sus datos de líquenes por CHLAL.

Como establecer su cuenta institucional de GBIF:

Metadatos

  • Ingresa a su cuenta de CHLAL y navegue al Manejo de Colecciones por Mi Perfil – Manejo de Especímenes – «Nombre de su Colección«:
  • En el Panel de Control de Administración tiene que Editar metadatos e Información de Contacto:
    • Revise si sus datos de contacto están correctos y actualizados [estos datos se van a utilizar en la pagina de GBIF para identificar su colección; por lo que es muy importante que la información sea suficientemente especifica para que la colección tenga un identificación única, incluso afuera del portal de CHLAL].
    • Se recomienda verificar una vez más, que su colección de CNALH utiliza identificadores únicos globales (GUIDs) para cada instante de ocurrencia. [GBIF utiliza estos GUIDs para identificar cada muestra especifica en su colección; eso es necesario para actualizar la información].
    • Para habilitar la subida a GBIF marque «Publish to Aggregators
    • No olvide «guardar los cambios» (Save Edits).
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Crear y actualizar un Archivo de Darwin Core: como empaquetar su datos y enviarlos a GBIF …

  • Regresa al menú para manejar sus colecciones y haz clic en el botón para “Publicar un Archivo de Darwin Core” en el Panel de Control Administrativo.
  • En el panel para “Publicar un Archivo de Darwin Core” es necesario ingresar la Clave con que GBIF identifica a su Organización:
    • Para obtener esta clave es necesario visitar la pagina de su institución en GBIF y copiar la sección de 36 signos del código antes del «/» de la URL de esta pagina. El formato de esta clave de GBIF es lo siguiente:
      xxxxxxxx-xxxx-xxxx-xxxx-xxxxxxxxxxxx
      [ver soporte adicional en el capitulo que sigue las instrucciones aquí (con capturas de pantalla)]
    • Alternativamente, usted puede ingresar el URL entero en este campo para la clave de GIBIF, el sistema sabe extraer la clave automaticamente.
  • Finalmente es necesario tocar el botón Validate Key. Si la clave funciona, la pagina mostrará las instrucciones a seguir y un botón para someter sus datos a GBIF:
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  • Antes de someter sus datos GBIF, es necesario ponerse en contacto con el GBIF help desk y pedir permiso para crear y actualizar sus datos en la pagina de GBIF para su institución. Usted puede ver su nombre de usuario asociado con su colección en la pagina de Symbiota (es decir CHLAL) en el parágrafo encima del botón para someter sus datos a GBIF.
  • Haz clic en la direccion electrónica de GBIF para generar automáticamente un correo con un borrador de una mensaje para enviarlo a GBIF (helpdesk@gbif.org):
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Una vez GBIF da la luz verde, usted tiene permiso para subir sus datos. Hay que regresar a la pagina para publicar sus datos en el formato de Darwin Core, eso quiere decir que ahora usted puede tocar el botón para someter sus datos (= submit data). Como confirmación usted va recibir la URL con el acceso a sus datos en la pagina de GBIF. Estos datos no estarán displonibles directamente. Paciencia: por lo general toma por lo menos una hora antes que sus datos sean indexados y estén disponibles.

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Bien Hecho !!!

Soporte Adicional (GBIF) –

Para encontrar su institución en GBIF y así obtener la clave para publicar los datos de su institución…

  • Usted tiene que navegar a la pagina https://www.gbif.org and click on Publishers above the search bar.
  • en la siguiente pagina ingresa el nombre de su institución (o por lo menos algunas palabras claves) en la barra de búsqueda para encontrar su institución en la parte derecha; haga clic para llegar as su pagina de GBIF:
  • La clave de su institución es la sigla de 36 caracteres que sigue inmediatamente la URL https://www.gbif.org/publisher/ dentro de la barra de direccion de su browser. Esta clave tiene 32 signos alfanumérico y 4 guiones, del siguiente formato: xxxxxxxx-xxxx-xxxx-xxxx-xxxxxxxxxxxx.

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